精準(zhǔn)醫(yī)療(Precision Medicine)是以個(gè)體化醫(yī)療為基礎(chǔ)、隨著基因組測序技術(shù)快速進(jìn)步以及生物信息與大數(shù)據(jù)科學(xué)的交叉應(yīng)用而發(fā)展起來的新型醫(yī)學(xué)概念與醫(yī)療模式。
精準(zhǔn)醫(yī)療作為下一代診療技術(shù)，在精準(zhǔn)性和便捷性上，較傳統(tǒng)診療方法有很大的技術(shù)優(yōu)勢。一方面通過基因測序可以找出癌癥的突變基因，從而迅速確定對癥藥物，省去患者嘗試各種治療方法的時(shí)間，提升治療效果;另一方面，基因測序只需要患者的血液甚至唾液，無需傳統(tǒng)的病理切片，可以減少診斷過程中對患者身體的損傷。
精準(zhǔn)醫(yī)療 機(jī)遇與挑戰(zhàn)并存
貴州貴安精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究院股份有限公司主要核心技術(shù)聚集于基于第三代基因測序技術(shù)為核心的優(yōu)生優(yōu)育醫(yī)學(xué)轉(zhuǎn)化、精準(zhǔn)醫(yī)療、中藥現(xiàn)代化技術(shù)及臨床試驗(yàn)、生物抗癌藥物研發(fā)及生物制品研發(fā)五大平臺(tái)。目前已建立集成化的中國最大的第三代基因測序中心，擁有目前最新的中藥新藥研發(fā)體系，與國內(nèi)一流的腫瘤醫(yī)院和傳染病醫(yī)院建立了合作聯(lián)盟，在國際上具有獨(dú)特的優(yōu)勢和基礎(chǔ)。
第三代基因測序技術(shù)具有讀長較長、樣本簡單、靈敏度高的特點(diǎn)，但測序準(zhǔn)確率低，需要重復(fù)處理進(jìn)行糾正。因此貴安精準(zhǔn)醫(yī)療公司目前使用的處理平臺(tái)面臨以下難題：
①數(shù)據(jù)處理計(jì)算量大，對CPU性能要求較高。
②對網(wǎng)絡(luò)的需求比較大，節(jié)點(diǎn)間需要使用低延時(shí)、高帶寬的Infiniband高速網(wǎng)。
③序列比對計(jì)算間斷性的讀寫硬盤存儲(chǔ)性能越高，計(jì)算速度越快。數(shù)據(jù)訪問量巨大，對存儲(chǔ)性能、容量要求高。
④純?nèi)唇榆浖蟾咝阅芊植际接?jì)算集群有高IO、大內(nèi)存、高帶寬、高穩(wěn)定性等特點(diǎn)。
⑤生物基因類開源軟件眾多，部署復(fù)雜。
⑥部分應(yīng)用的工作流程較為復(fù)雜，對自動(dòng)化程度要求高。
“曙光經(jīng)驗(yàn)”搭建新一代生物信息處理平臺(tái)
為滿足貴安精準(zhǔn)醫(yī)療公司現(xiàn)階段業(yè)務(wù)數(shù)據(jù)處理平臺(tái)的需求，如中醫(yī)藥現(xiàn)代化研發(fā)、生物制劑研發(fā)、基因測序、蛋白質(zhì)分析等應(yīng)用，曙光針對第三代基因測序平臺(tái)的特點(diǎn)，并結(jié)合自身在生命科學(xué)領(lǐng)域多年的技術(shù)積累，采用最新一代生物信息處理解決方案來構(gòu)建業(yè)務(wù)處理平臺(tái)。
曙光提供的基于第三代測序平臺(tái)的技術(shù)服務(wù)及領(lǐng)先的整體解決方案，包括高密度的計(jì)算平臺(tái)、高性能的存儲(chǔ)系統(tǒng)、高速的數(shù)據(jù)網(wǎng)絡(luò)、簡單易用的生物信息應(yīng)用軟件系統(tǒng)和作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)以及系統(tǒng)全生命周期管理的在線運(yùn)維平臺(tái)。
針對客戶機(jī)房較小的情況，曙光采用TC4600E刀片服務(wù)器進(jìn)行搭建，其擁有更高計(jì)算密度、低系統(tǒng)功耗、低冷卻系統(tǒng)耗電量、布線簡單、更高可靠性、管理方便等特點(diǎn)。
針對第三代測序技術(shù)優(yōu)化的存儲(chǔ)分級(jí)功能，曙光提供高速的IO讀寫性能，提升隨機(jī)讀寫IOPS，并使存儲(chǔ)聚合帶寬達(dá)到30GB/s以上。
平臺(tái)采用業(yè)界領(lǐng)先的EDR InfiniBand網(wǎng)絡(luò)(100Gb/s EDR)，其網(wǎng)絡(luò)帶寬是FDR的1.78倍，延遲只有0.61us，比FDR延遲低1/7，是當(dāng)前最高帶寬、最低延遲的InfiniBand產(chǎn)品，更高帶寬、更低延遲的EDR能進(jìn)一步提高網(wǎng)絡(luò)密集型應(yīng)用程序的并行效率。
曙光提供生物信息應(yīng)用軟件系統(tǒng)和作業(yè)調(diào)度系統(tǒng)，打造一體化的生物信息處理平臺(tái)，使客戶業(yè)務(wù)處理平臺(tái)的計(jì)算更加高效。
為進(jìn)一步提高客戶業(yè)務(wù)處理平臺(tái)的運(yùn)維水平，曙光提供針對生物信息領(lǐng)域量身打造的EasyOP在線運(yùn)維平臺(tái)，可在數(shù)分鐘內(nèi)完成對生物信息處理平臺(tái)所有節(jié)點(diǎn)的監(jiān)控部署，客戶可通過Web瀏覽器和手機(jī)端隨時(shí)查看集群運(yùn)行狀態(tài)，并通過在線運(yùn)維平臺(tái)迅速定位故障并啟用自動(dòng)化處理機(jī)制。
HPC+精準(zhǔn)醫(yī)療，曙光助力生命科技發(fā)展
通過搭建曙光新一代生物信息處理平臺(tái)，貴安精準(zhǔn)醫(yī)療公司將成為西南地區(qū)領(lǐng)先的基因測序、中藥現(xiàn)代化技術(shù)、生物抗癌藥物研發(fā)及生物制品研發(fā)領(lǐng)域的領(lǐng)先企業(yè)，能夠快速響應(yīng)企業(yè)計(jì)算需求并得出結(jié)果。
采用“互聯(lián)網(wǎng)+”思維，將“曙光經(jīng)驗(yàn)”轉(zhuǎn)變?yōu)樵诰€服務(wù)主動(dòng)迎合客戶切實(shí)需求，曙光實(shí)現(xiàn)客戶資產(chǎn)全生命周期管理服務(wù)，并提供覆蓋資產(chǎn)全生命周期的全程專家支持的自動(dòng)化運(yùn)維。
曙光提供的生物信息處理解決方案能夠?yàn)橘F安精準(zhǔn)醫(yī)療公司提供高性能、易擴(kuò)展的數(shù)據(jù)處理平臺(tái)，加速科研和應(yīng)用成果的產(chǎn)生，促進(jìn)整個(gè)生命科技相關(guān)各行業(yè)的蓬勃發(fā)展。
轉(zhuǎn)型的最終目的 -提質(zhì)降本增效
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